主講嘉賓- 學界泰斗中研院李文雄院士
本次研討會有幸邀請到學界泰斗中研院 李文雄院士擔任主講者，李院士研究領域包括演化生物學、DNA序列分析方法、計算生物學等，其著作《Fundamentals of Molecular Evolution》及《Molecular Evolution》更成為該領域之教科書籍，並榮獲2019 Society for Molecular Biology and Evolution（SMBE，國際分子演化學學會）終身貢獻獎，彰顯其於分子生物學及演化領域之貢獻。
-Symposium-
康健基因生物資訊研討會
09:00~09:10 |Opening remarks 吳夢楚博士
09:10~10:00 |keynote speaker 中研院李文雄院士
Construction of gene regulatory networks
10:20~11:00 |中正大學 資訊工程系 黃耀廷教授
Algorithms in genome assembly and error correction
11:10~12:00 |長庚大學生物醫學系 黃柏榕助理教授
Mining the cancer variant
12:00~13:00 | nVIDIA 劉冠良博士
Improving Sequencing Analysis with Nvidia Clara Genomics and Parabricks
13:05~13:45 |台北醫學大學 醫資所 吳育瑋副教授
The predicting of antimicrobial resistance phenotypes from bacterial pan-genomes using machine learning algorithms
13:45~14:25 |政治大學資訊科學系 張家銘助理教授
From sequence alignment to phylogenetic reconstruction: how to enrich signal to noise ratio
14:40~15:20 |Oxford Nanopore technologies Bioinformatics Product Manager, Dr. Stephen Rudd
15:20~16:00 |高雄大學資訊管理系 楊子賢助理教授
Identifying piRNA targets on mRNAs in C.elegans using a deep multi-head attention network
16:00~16:40 |中國醫藥大學老化醫學研究中心 盧子喬 博士後研究員
Single-nucleus RNA-seq reveals transcriptomic alterations in response to starvation in whole animal
-Workshop-
康健基因生資工具產品發布和實作工作坊
康健基因Senior Bioinformatics Scientist 邱家軍先生
NanoJulia: a Julia-based quality control tool for nanopore sequencing data
1. Overview of accessible QC tools.
2. Problems in quality control of nanopore sequencing data.
3. Use NanoJulia to do QC on Fast5/Fastq/BAM-format files.
長庚大學人工智慧研究中心 楊崎 助理研究員
Manage data workflows in a portable, reproducible and scalable way
1. Reproducible bioinformatics and current workflow management systems
2. What's next? Turning your workflows into user-friendly applications
3. Introducing our solution: the next-generation data workbench
4. A miRNA analysis pipeline as a portable package
台灣人工智慧實驗室AI lab
TAIGenomics: tool and workflow for rapid clinical genomics data decoding
*本次工作坊的參與者無需程式語言撰寫能力，但有執行過生物資訊分析流程經驗者更佳
